Instytut Ekonomii, Finansów i Zarządzania UJ oferuje możliwość kształcenia na dwuletnich studiach II stopnia, w trybie stacjonarnym i niestacjonarnym, na następujących kierunkach:
| Kierunek | Tryb |
| Ekonomia | Stacjonarne |
| Rachunkowość i zarządzanie finansami | Stacjonarne |
| Niestacjonarne | |
| Zarządzanie – psychologia w zarządzaniu | Stacjonarne |
| Niestacjonarne | |
| Zarządzanie zasobami ludzkimi | Stacjonarne |
| Niestacjonarne | |
| Finanse i controlling | Stacjonarne |
| Niestacjonarne | |
| Marketing i logistyka | Niestacjonarne |
| Business and Finance Management | Stacjonarne |